集群使用概览
欢迎使用北京大学智慧药物平台高性能计算集群！
TIP
在开始使用之前，建议您先仔细阅读本手册，以便快速上手并充分发挥集群的性能。
集群简介
北京大学智慧药物平台高性能计算集群（简称 BJMUHPC），隶属北京大学天然药物及仿生药物全国重点实验室大型仪器平台，由教育部重大科研基础设施项目支持建设，致力于为人工智能驱动的新药创制提供强大的计算支持，成为推动创新药物研发的重要科研平台。
集群集成了 CPU 节点、GPU 节点、胖节点与高性能存储，能够支撑 分子结构预测、虚拟筛选、分子动力学模拟、量子化学计算、深度学习模型训练 等多样化科研任务，为研究人员提供高效、可靠的算力支撑。
集群配置
| 资源 | 配置 |
|---|---|
| CPU节点 | 52 台，总计 3,328 核心 |
| 胖节点 | 3 台 ，配备 1TB 大内存 |
| GPU节点 | 10 台，配置 16 × H100、8 × A800、24 × L40S、9 × L40，总算力约 13 PFLOPS |
| 存储系统 | 双套存储阵列，总容量 4 PB |
集群服务
该集群可为以下任务提供强大算力支持：
- 蛋白质与核酸分子三维结构预测
- 大规模分子库虚拟筛选与分子对接
- 长时间尺度的分子动力学模拟
- 药效团构建与小分子从头设计
- 高精度量子化学计算
- 数据挖掘与深度学习模型训练
- AI驱动的分子生成和分子优化
集群登录机制
本平台的登录过程由三层组成：
1. 防火墙 VPN
用户需首先通过 VPN 客户端接入校园网络，建立安全隧道。
2. 堡垒机
堡垒机统一管理密钥，并负责发起后续登录请求（ssh、sftp、xfwd）。
用户认证仅在堡垒机完成，之后访问集群节点时无需再次输入密码，提升安全性与便捷性。
3. 集群登录节点
- ssh 登录:
通过 Web 界面或本地终端工具（Xshell、CMD/PowerShell 等）进入login01–04，适合命令行交互和任务提交。- xfwd 图形界面登录：
通过login05–07提供图形化环境（如交互式建模、可视化分析、深度学习训练等）。- sftp 文件传输：
可通过 Web 界面调用 FileZilla，或在本地终端执行 sftp 命令连接login01–04进行文件上传与下载。
bash
集群登录机制
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用户终端
│
▼
防火墙 VPN
│ 建立安全隧道
▼
堡垒机
│ • 统一密钥管理
│ • 完成用户认证
│ • 发起 ssh / sftp / xfwd 请求
▼
集群登录节点
├── 🔑 ssh 登录
│ • 命令行交互
│ • Slurm 作业提交
│
├── 📂 sftp 文件传输
│ • FileZilla 图形化工具
│ • sftp 命令行传输
│
└── 💻 xfwd 图形界面登录
• 可视化交互
• 支持 GUI 必需软件完成上述登录步骤后，用户即可进入集群环境，根据需要选择命令行操作、文件传输或图形界面进行工作。